期刊简介
本刊由著名泌尿外科专家吴阶平、郭应禄院士任名誉主编，聘请国内泌尿界知名专家、教授担任顾问及编辑委员会委员。该杂志为泌尿外科专业学术期刊，刊登国内外最新的泌尿外科疾病的诊断及最先进的治疗方法等。
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首页>现代泌尿外科杂志
- 杂志名称：现代泌尿外科杂志
- 主管单位：中华人民共和国教育部
- 主办单位：西安交通大学
- 国际刊号：1009-8291
- 国内刊号：61-1374/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：西安交通大学期刊中心评为优秀进步奖（02）期刊收录：知网收录(中), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 万方收录(中), CA 化学文摘(美), 维普收录(中)
应用生物信息学筛选前列腺癌潜在生物标志物
石胜军；田斌群
关键词：前列腺癌, 生物信息学, 基因芯片, 差异表达基因
摘要：目的 运用生物信息学方法筛选前列腺癌潜在生物标志物.方法 从GEO数据库上下载编号为GSE55945的基因芯片数据集,使用R软件获取差异表达基因,然后通过蛋白互作网络等筛选出枢纽基因并进行初步验证.结果 通过差异基因筛选,得到差异表达基因462个,其中上调基因114个,下调基因348个.基因本体功能富集分析显示差异表达基因主要参与肌肉系统、系统生物过程调节、循环系统等生物过程;京都基因与基因组百科全书通路富集分析显示这些差异表达基因主要涉及粘着斑、蛋白聚糖、cAMP信号通路及钙离子信号通路等通路.通过蛋白互作网络筛选出6个备选枢纽基因,基于TCGA对枢纽基因进一步筛选,终筛选得到3个枢纽基因:VCL、RND3、RRAS.ROC曲线结果显示枢纽基因能够区分前列腺癌及正常组织(AUC＞0.7,P＜0.001).结论 通过生物信息筛选的得到的枢纽基因可能为前列腺癌进一步研究提供线索,可能成为前列腺癌早期诊断标志物及治疗靶标.
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